Introducción: La epidemia de VIH en Cuba se caracteriza por una baja prevalencia y una elevada diversidad genética. El conocimiento de los subtipos circulantes del VIH, sus tendencias evolutivas y el comportamiento de la resistencia a los antirretrovirales (ARV) constituyen premisas fundamentales en la vigilancia epidemiológica.

Objetivos: Evaluar la emergencia de la diversidad genética del VIH-1 y la resistencia transmitida a los ARV en una muestra de la población cubana de reciente diagnóstico.

Métodos: Se estudiaron 218 muestras de pacientes diagnosticados con la infección por VIH-1 entre junio de 2009 y diciembre de 2012. Se determinaron el subtipo viral y las mutaciones asociadas a resistencia (MAR). Se estimó la historia evolutiva del subtipo viral predominante en la muestra estudiada.

Resultados: Se observó un predominio del subtipo B (34.9 %) y un incremento de la FRC19_cpx (24.8 %) y la FRC BG (18.3 %) con respecto a estudios anteriores. Se describió por primera vez en Cuba la circulación de la FRC05_DF. El análisis de la historia evolutiva del subtipo B sugirió la introducción de este subtipo en Cuba en el año 1977 y su asociación geográfica con cepas virales procedentes de Estados Unidos. El 20.2 % de las muestras estudiadas presentaron MAR, valor que se considera alto para la vigilancia de la resistencia transmitida, según la Organización Mundial de la Salud (OMS). La resistencia detectada se asoció con los ARV empleados en la primera estrategia de tratamiento en Cuba.

Conclusiones: Los resultados del presente estudio avalan la importancia de mantener una estrecha vigilancia epidemiológica en Cuba.